公诉案件流程一般分为三个阶段，即机关的侦查阶段、公诉机关的审查起诉阶段、的审判阶段。按照规定，认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，应当作出起诉决定。检察机关审查起诉的时间为1个月，重大，复杂案件可以延长半个月;对于需要补充侦查的，可以退回机关补充侦查。退回补充侦查以两次为限，每次不超过2个月。公诉机关审查起诉阶段结束后，应当及时将案卷移送审理。人民审理公诉案件，应当在受理后二个月以内宣判，至迟不得超过三个月。对于可能判处死刑的案件或者附带民事诉讼的案件，以及有本法第一百五十六条规定情形之一的，经上一级人民批准，可以延长三个月;因特殊情况还需要延长的，报请最高人民批准。
一、我国对不起诉适用的程序包括：
1、审查。经过审查起诉，认为需要作不起诉处理的，承办案件的检察官应当写出审查报告，经部门负责人审核，报主管检察长决定或由主管检察长提交检察委员会讨论决定。
2、决定不起诉。不起诉的决定权由检察长和检察委员会行使。
3、宣布和送达。人民应公开宣布不起诉决定，并将不起诉决定书分别送达被不起诉人及其所在单位、被害人或者其近亲属以及被害人的诉讼代理人。送达时，应当告知被害人或者其近亲属、诉讼代理人，如果对不起诉决定不服，可以自收到不起诉决定书后7日内向上一级人民申诉，也可以不经申诉直接向人民起诉。
4、不起诉的善后工作。不起诉决定宣告及送达后，应及时解除强制措施，解除扣押、冻结，对需要给予被不起诉人行政处罚、行政处分或没收其违法所得的提出检察意见并移送有关主管机关处理等。
5、报请批准。省级以下人民对直接受理侦查案件作不起诉决定的要报上一级人民批准。
二、公诉案件包括哪些案件？
1、审理刑事案件，分公诉和自诉两种。公诉案件，由人民代表国家向人民提起诉讼;自诉案件，由被害人自己或其法定代理人向人民提起诉讼。
2、不告不理”是人民处理案件的一条基本原则。根据新的刑事诉讼法的规定，自诉案件包括下列案件：
(1)告诉才处理的案件;
(2)被害人有证据证明的轻微刑事案件;
(3)被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身，财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而机关或者人民不予追究被告人刑事责任的案件。
除了以上情况，都是公诉案件
3、人民审理公诉案件，应当在受理后一个月以内宣判，至迟不得超过一个半月。有刑事诉讼法第一百二十六条规定情形之一的，经省、自治区、直辖市高级人民批准或者决定，可以再延长一个月。
4、人民改变管辖的案件，从改变后的人民收到案件之日起计算审理期限。
5、人民补充侦查的案件，补充侦查完毕移送人民后，人民重新计算审理期限。
法律依据：《中华人民共和国刑事诉讼法》 第一百八十七条 人民决定开庭审判后，应当确定合议庭的组成人员，将人民的起诉书副本至迟在开庭十日以前送达被告人及其辩护人。
在开庭以前，审判人员可以召集公诉人、当事人和辩护人、诉讼代理人，对回避、出庭证人名单、非法证据排除等与审判相关的问题，了解情况，听取意见。
人民确定开庭日期后，应当将开庭的时间、地点通知人民，传唤当事人，通知辩护人、诉讼代理人、证人、鉴定人和翻译人员，传票和通知书至迟在开庭三日以前送达。公开审判的案件，应当在开庭三日以前先期公布案由、被告人姓名、开庭时间和地点。
上述活动情形应当写入笔录，由审判人员和员签名。
